华为云首发集成希望组NextDenovo软件 云技术普惠生物科技

　　　　历经数十年的发展 如今基因测序技术已经在基础研究 技术研发和临床实践上得到了广泛的应用 据预测 基因测序市场未来五年复合增长率在35%左右 2022年有望突破300亿美元。逐渐完善的检测技术和不断降低的设备成本使基因测序逐渐普及 这一技术对生物科技研究和医学界的影响也越来越大。

　　　　不久前 希望组在Github上线了三代测序数据高效纠错 组装软件NextDenovo最新版本V2.0-beta.1 面向全球范围开源并为学术研究和其它非商业用途免费开放。据悉 本次希望组发布的NextDenovo最新版不但解决了现有三代测序数据组装工具资源占用大 运行时间长 组装质量不稳定的瓶颈 还实现了单Contig一条染色体和超大型基因组组装的突破 为利用三代数据组装基因组扫清了组装算法的障碍。

　　　　目前华为云基因容器已经率先集成了NextDenovo最新版 用户无需下载源码 编译和安装等复杂过程 可以直接上传脚本进行数据分析 极大简化了使用流程 并且免除了后续资源 应用维护的烦恼。

　　　　华为云推出基因容器服务GCS 助力行业突破瓶颈

　　　　基因测序对密集计算和海量数据处理能力有较高的要求 尤其是随着第三代基因测序技术的研发和广泛应用 数据量较之第二代有了百倍增长 在呈现更加精准的测序结果的同时 也给基因测序企业带来了算力 存储能力等IT资源的压力。基因测序市场的火爆将这一系列问题逐渐放大 成为阻碍行业和技术发展的“绊脚石”。

　　　　2018年 华为云全球首家推出了以Kubernetes为基础的基因容器服务GCS 将基因测序与容器技术完美地结合在了一起。据悉 基因容器服务GCS是华为云在Kubernetes封装了一层关于基因测序的抽象 让基因行业可以迅速部署和使用容器技术 帮助基因行业的用户提高资源利用率 轻松应对波峰波谷 降低环境搭建的复杂性。

　　　　具体来讲 针对基因行业普遍存在的工具碎片化 开发语言多样 系统维护困难等瓶颈 华为云的基因容器解决方案有“快 省 易 捷”的特点。

　　　　“快”是指极速测序：GCS支持10万容器规模 可以超高并发运行测序分析流程 大幅缩短测序市场 面对大规模并发 得益于高性能容器批量计算平台Volcano的高效任务调度能力 可以避免任务的死锁 减少等待时间 进一步提升测序分析效率;

　　　　“省”来自于华为云的高性价比：算力资源按需 按秒计费 CPU和内存则根据业务诉求灵活配比 避免浪费 有效帮助企业降低成本;

　　　　“易”在于免运维：基于Severless架构的容器服务 集群资源自动化扩缩容 分析流程根据预置规则可以自动化处罚和执行;

　　　　“捷”则体现在华为云带来的一站式服务：将基因测序分析与数据挖掘能力统一到一套流程里面 避免多套系统操作带来的不便。

　　　　基于轻量级的容器技术 GCS结合了大数据 深度学习算法 为测序厂商提供了灵活可定制的测序流程 秒级可伸缩的高可靠资源和便捷一站式用户体验 结合希望组在基因行业内多年来的业务积累 更贴近基因测序行业客户的诉求 让基因测序数据的计算更省 更快 更轻松。

　　　　技术赋能行业 助力基因企业创新发展

　　　　据了解 除希望组外 国内基因行业Top 15的企业中已经有14家采用了华为云的服务。其中 上海其明信息技术有限公司在华为云容器CCI支持下 其基因检测与基因云计算的综合平台GCBI已经完成了25万例基因数据分析和挖掘 协作作出1万多次基于基因信息的临床决策。数据显示 将业务部署在华为云CCI上后 上海其明的实际计算成本降低了30%-50% 实现了K8S和物理资源免运维。

　　　　不仅如此 在AI辅助病理诊断应用开发方面 华为云还与金域医学合作取得过突破性进展 金域医学病理专家团队与华为云AI团队合作 首次基于病理形态学 通过深度学习技术 训练出精准 高效的AI辅助宫颈癌筛查模型。该模型在排阴率高于60%的基础上 阴性片判读的正确率高于99%。同时 阳性病变的检出率超过99.9% 是目前国际上已公布的AI辅助宫颈癌筛查的最高水平。

　　　　华为云致力于做智能世界黑土地 以信息技术赋能各行各业 并持续加大研发投入 助力千行百业在5G+云+AI的驱动下实现转型升级。华为云与基因行业的跨界结合帮助基因企业解决了底层技术难题 全力聚焦业务创新 未来也必将极大地加速基因测序等科学技术领域的发展。